我承包了甲方给我村修建的安置房，甲方在镇

甲方的手续太多了，不知道你们现在到哪个程度了，已经完成了手续，还有什么手续没完成。再说了你也没讲清楚是哪类厂子的二期工程，分别类型的厂子报批的手续也不相同。下面就只能简单的按基本建设工程的情况列一些基本的手续。
1、事项的立项手续。分别规模的事项报分别级别的行政主管部门审批。通常是发改委或发改局。
2、土地使用证报批手续。主管单位：国土局
3、用地规划许可手续。主管单位：规划局、国土局
4、环境影响评估：环保局
5、消防安全。公安局
6、施工许可证：各种手续都齐全了以后报建委（或相应的行政主管部门）批。以上那些只是最基本的多少个手续，还有根据分别性质的工程，牵涉分别的部门，也要进行相应的报批手续。
7、如果牵涉到地下文物，还需进行文物调查，报文物管理单位批。
8、牵涉到行洪排涝要水利部门批。具体情况具体对待，反正只有拿到施工许可证了以后，才能够进行施工。