用人单位只给我上了个人交的医疗保险单位没帮我交他的那一部分，该怎么办?

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申请卫生行政部门投诉或实施行政裁决。对行政裁决的不服，可以通过行政复议或诉讼再次进行解决。
医疗纠纷处理有几个途径。
一是协商。医患双方就赔偿问题进行协商，达成一致意见，双方签订协议书，可以办理公证或律师见证，并报卫生行政主管部门备案。
二是第三方调解。医患双方本着自愿、合法、公正的原则，在医调委进行调解。
三是申请卫生行政部门处理。当事人应当提出书面申请，并在知道或应当知道身体健康受到损害之日起1年内提出。
四是向人民法院起诉。医疗纠纷可以不向卫生行政部门申请处理，直接向人民法院提起诉讼，以侵权为案由的，诉讼时效为1年，以违约为案由的，诉讼时效为2年，均自知道或应当知道自己的权益受到侵害之日起计算。
这就是医疗投诉部门的情况，请参照。

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根据你的问题解答如下, 解决医疗纠纷的方法有：
一、医患双方协商调解
与诉讼方式比较起来，医患双方协商和解医疗纠纷的优势体现在几个方面。
1、成本低廉、效率较高。协商通常是医患双方直接商谈，不存在第三方，所以在协商过程中双方容易找到对医疗行为、医疗结果及其原因认识的分歧点和解决纷争的关节点，从而快捷地解决争议，节省双方通过诉讼方式解决争议所需要的大量的精力和财力。
2、可以在很大程度上消弥因医疗纠纷所产生的医患对立，为医患双方提供了相互理解和谅解的机会。
3、有利于节约有限的司法资源，促进社会稳定。然而协商和解医疗纠纷的上述优势要充分发挥有一个重要的前提，即医患双方遵守法律规定，理性地、友好地进行协商。但在现实当中，协商和解医疗纠纷已经成为医患双方的无奈，随着协商和解越来越多，其弊端也日益显现。
二、申请卫生行政部门处理
当事人申请卫生行政部门处理的，由医疗机构所在地的县级人民政府卫生行政部门受理。医疗机构所在地是直辖市的，由医疗机构所在地的区、县人民政府卫生行政部门受理。
三、向提讼
向提讼是当事人在遇到医疗纠纷是最后的选择。通过对案情的客观分析与看待，公正的处理医院与当事人双方之间的矛盾，这是解决医疗纠纷的最后防线。