1、性质不同：罚金是我国《刑法》规定的一种附加刑，既可以附加于主刑适用，也可以独立适用;罚金作为一种财产刑，以剥夺犯罪人或犯罪单位的金钱为内容，是人民法院剥夺犯罪人或犯罪单位财产权利的最严厉的法律制裁方法。司法罚款是人民法院对妨害民事、行政诉讼行为采取的强制措施，目的是制裁妨害诉讼的行为，防止妨害诉讼行为的再次发生。行政罚款是行政机关对违反行政法律规范行为的处罚方式，是行政机关剥夺行政相对人部分财产权利的具体行政行为。
2、作出决定的机关不同：罚金由人民法院在《刑事判决书》中作出判决;司法罚款由人民法院作出《决定书》;行政罚款由主管行政机关、法律法规授权的组织或者受行政机关委托的组织依法实施，作出《行政处罚决定书》。
3、法律依据不同：人民法院判处罚金的法律依据是《刑法》和《刑事诉讼法》。人民法院作出罚款决定的法律依据是《民事诉讼法》和《行政诉讼法》。行政机关作出罚款决定的法律依据是有关行政法律规范和《行政处罚法》。
