工程欠款已过诉讼时效，要怎么处理

工程欠款已过诉讼时效，只是丧失了运用法律保护的权利。实体债权债务并没有消失，还可以与对方协商，看能不能支付或部分支付工程欠款。搜集诉讼时效中断的证据。如查明存在诉讼时效中止或中断情形的，则支持债权人诉讼请求。
法律依据：
《民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。