劳动合同补偿金是否要扣税

程某在一家网络公司工作。
最近，公司因亏损裁员，裁到了他的身上。
网络公司经理与程某谈话后，双方协商签订了解除协议书。
其中约定，自即日起网络公司与程某解除劳动合同，待程某办完离职手续后，网络公司按国家规定向其支付解除劳动合同的经济补偿金。
程某一边办理离职手续，一边盘算着自己将得到的补偿金数额：我在这儿工作已经3年多了，按规定可以拿4个月工资的补偿金我每月的工资平均有5000多元，这样，4个月工资起码也应有2万元吧。
程某没有想到的是，财务人员发给他的补偿金只有1万多元。
他问及原因时，财务人员解释道：“给你计算出来的补偿金的确是2万元，但扣除个人所得税后，就剩这么多了。
”“个人所得税?难道我领到的解除合同经济补偿也要上这个税吗?”
根据规定，网络公司与程某通过签订协商解除劳动合同协议的形式，解除双方的劳动合同是合法行为合同解除后，网络公司向程某支付4个月工资作为经济补偿金，也是合法的。
但网络公司在向程某支付经济补偿金时，所扣缴的个人所得税却是错误的。
其理由如下：从税收的角度来说，如果把劳动者这样获得的一次性经济补偿，直接作为工资、薪金所得，纳入征缴个人所得税基数，对劳动者是不公平的。
国家在《关于个人与用人单位取得的一次性补偿收入免征个人所得税问题的通知》中规定：个人因与用人单位解除劳动关系而取得的一次性补偿收入(包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费用)，其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税超过的部分计算征收个人所得税。

《劳动合同法》第十条
建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。
已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
第十九条
劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。
同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期。
以完成一定工作任务为期限的劳动合同或者劳动合同期限不满三个月的，不得约定试用期。
试用期包含在劳动合同期限内。劳动合同仅约定试用期的，试用期不成立，该期限为劳动合同期限。
第三十九条
劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
第四十条
有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
（一）劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；
（二）劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；
（三）劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。