(一)区分本罪与非罪的界限
如果行为人主观上不是明知，而是由于其业务知识、经验不足，或者是调查研究不够充分，工作作风不够深入，思想方法简单等造成认识偏颇而发生的错误行为，即使造成一定危害后果的，一般也不构成犯罪，如果情节严重或者造成重大后果而构成其他犯罪的，应以其他相应犯罪论处。
(二)本罪在主观方面必须出于故意且具有徇私目的
如果出于过失，玩忽职守而致走私行为得以放纵，或者没有徇私目的，而滥用职权放纵走私的，则只有给公共财产、国家和人民利益造成重大损失时才能构成犯罪，但也不是本罪，而是构成玩忽职守罪、滥用职权罪等。
(三)共同犯罪
行为人如与走私犯罪分子相互勾结，利用职权为走私犯罪分子提供方便，构成犯罪的，则应以走私罪的共犯论处。
(四)区分本罪与徇私舞弊不移交刑事案件罪的界限
存在以下明显的区别：
1、主体不同。本罪主体仅限于海关工作人员;而后者则为行政执法人员，包括前者在内但比前者广泛得多。
2、客观方面不同。本罪表现为徇私舞弊，放纵走私，情节严重的行为;而后者则表现为徇私舞弊，对依法应当移交司法机关追究刑事责任的不移交，情节严重的行为。显然，本罪一般是纯正的不作为，即对走私行为完全不采取措施，予以放纵;后者则对走私行为作了处罚，只不过是应当移交司法机关而未移交。
3、对象不同。本罪对象为走私分子，既可以是具有走私行为但不构成走私犯罪的一般违法分子，又可以是走私犯罪分子;而后者则必须是走私犯罪分子，否则，即不可能构成其罪。
