行政机关办理行政处罚案件期限是多长时间

按照相关规定，行政机构应在对行政违规行为进行立案调查后的九十个自然日内做出行政处罚决断。
若法律、法规或规章中另有明确规定，则须依照这些规定执行。《行政处罚法》第四十六条
作出罚款决定的行政机关应当与收缴罚款的机构分离。
除依照本法第四十七条、第四十八条的规定当场收缴的罚款外，作出行政处罚决定的行政机关及其执法人员不得自行收缴罚款。
当事人应当自收到行政处罚决定书之日起十五日内，到指定的银行缴纳罚款。银行应当收受罚款，并将罚款直接上缴国库。